DNA大小选择后DNA采血卡中ctDNA的检测

  循环肿瘤DNA(CtDNA)的研究和临床应用的新进展受到样本收集的实际考虑而受到限制。全基因组测序(WGS)越来越多地被用于ctDNA分析、识别拷贝数改变、片段大小模式和其他基因组特征，我们假设低深度的WGS数据可能是从极少量的无细胞dna中产生的，而片段大小的选择可能有效地去除小容量血液中的基因组dna(Gdna)污染。使用DNA采血卡具有实际优势，因为这些方法易于收集，便于连续取样，并支持前瞻性人类研究中的新研究设计、动物模型和通过小批量去除gDNA来扩大档案样本的利用。

  因此，我们制定了从DNA采血卡中分离和分析无细胞DNA的方法。通过对一例黑色素瘤患者50μL冷冻全血干血斑的分析，根据肿瘤特异性体细胞拷贝数的改变对ctDNA进行了鉴定，发现其片段大小与传统方法处理的血浆中的片段大小相似。我们将此方法扩展到从小鼠移植瘤模型中检测干血斑中的无肿瘤细胞DNA，并能够从原始移植腹水中识别ctDNA。我们的数据表明，ctDNA可以在干血斑中被检测和监测。这将为从病人收集样本提供新的方法。